Negli anni (20)‘10 si è passati dal vedere l’essere umano come un unico organismo a sé stante, a un ecosistema denominato olobionte che comprede l’ospite (essere umano) e l’insieme dei microrganismi che lo popolano (microbioma). Ora, l’evoluzione va verso il meta-olobionte, dove l’olobionte è parte integrante dell’ecosistema che occupa. Un unico grande eco-organismo.

🔬 Scienza del microbiota umano

Gli alimenti fermentati aiutano a eliminare i metalli pesanti dal corpo

Qualche tempo fa è uscito un articolo in cui si dimostrava come alcuni batteri lattici presenti nel kimchi fossero in grado di legarsi a particelle di microplastiche e portarle fuori dall’organismo, ovvero una sorta di effetto detox delle microplastiche.

Oggi si è fatto un passo avanti, con un interessante articolo che ha raccolto tutte le evidenze su un tema simile: capacità degli alimenti fermentati di eliminare i metalli pesanti nel nostro organismo.
Prima di tutto, la review si concentra sull’esposizione ai metalli pesanti a livello basso, continuativo e cronico, attraverso l’alimentazione. In pratica quanto ne accumuliamo a lungo termine semplicemente mangiando. Esclude esposizioni acute e temporanee.
Gli alimenti fermentati possono mitigare l’avvelenamento cronico da metalli pesanti attraverso 4 vie principali:

• Modulazione della disponibilità dei metalli pesanti. I microrganismi e i loro composti che caratterizzano l’alimento fermentato rispetto allo stesso fresco (e.g. metaboliti, postbiotici) si legano ai metalli pesanti o li incamerano, impedendo al nostro corpo di assorbirli.

• Rinforzo della barriera intestinale. Gli alimenti fermentati possono contribuire a rinforzare la funzionalità dell’intestino, impendendo ai metalli pesanti di superare questa barriera ed entrare in circolo.

• Protezione dalla tossicità. Inserire alimenti fermentati nella dieta contribuisce a limitare l’infiammazione e lo stress ossidativo, rendendo le cellule più resistenti agli effetti tossici dei metalli pesanti. Una cellula in forma risponde meglio.

• Promozione dell’eliminazione. Gli alimenti fermentati possono incentivare funzioni fisiologiche del corpo che contribuiscono a eliminare i metalli pesanti dal corpo, una sorta di effetto detox.

In conclusione, gli alimenti fermentati possono seriamente contribuire a limitare gli effetti dell’esposizione quotidiana ai metalli pesanti attraverso gli alimenti, ma ora sono necessari esperimenti che verifichino causa ed effetto. Intanto, aggiungete un po’ di crauti o kimchi al vostro panino della pausa pranzo.

Fonte verificata: Esfandi, Lacika et al. 2026, Trends in Food Science & Technology
DOI: 10.1016/j.tifs.2026.106049

🌍 One Health & microbioma ambientale

L’olobionte non è più il modello da seguire

Il filone dell’olobionte umano ha preso piede negli anni ‘10 (i.e. 2010) e rappresentava un importante cambio di paradigma nel modo in cui si concepiva a biologia umana. L’essere umano non è un singolo organismo ma un ecosistema marciante, fatto di cellule umane e microrganismi. Anzi, fatto più di microrganismi che cellule umane. Oggi questo concetto viene rivisto e ampliato, prendendo come unità funzionale biologica l’ecosistema che l’organismo occupa. Si passa quindi da olobionte a meta-olobionte, una sorta di eco-organismo e il modello da studiare proposto è quello marino.

In uno studio* appena pubblicato, l’ambiente marino sembra essere il modello ambientale perfetto per studiare le dinamiche del meta-olobionte. Molti organismi di questo ambiente sono ancorati al substrato, anche contribuendo a costruire il substrato stesso (pensate a una barriera corallina). ed entrano in connessione fra loro grazie all’acqua che trasporta microrganismi e prodotti del metabolismo di questi. I vari organismi dello stesso ambiente si influenzano mettendo in connessione i loro microbiomi.
Studiare e comprendere le dinamiche che regolano il modello meta-olobionte, permette di attuare strategie di ripristino e conservazione ambientale più efficaci. Si può immaginare che anche la posizione e distanza fra le varie specie possa influire sulla loro sopravvivenza, in virtù dello scambio attivo fra queste.

Possiamo trasporre questo stesso modello anche sull’ambiente terrestre e nelle città. La città diventa un meta-olobionte urbano dove il posizionamento dei parchi e della vegetazione diventa cruciale in funzione anche ad esempio dei venti dominanti o dell’esposizione alla luce naturale influenzata dagli edifici.

Nella vita di tutti i giorni, l’unico carrier biologico naturale che abbiamo a disposizione, sono gli alimenti fermentati. Esattamente come una corrente marina, il fermentato trasporta microrganismi e postbiotici dall’ambiente all’essere umano, sfruttando la fermentazione degli alimenti. Un ottimo fermentato parte sempre da un alimento coltivato in un ambiente sano.

Fonte verificata: Manea, Bramanti, Galand 2026, Trends in Microbiology
DOI: 10.1016/j.tim.2026.08.003

*Uno degli autori di questo articolo, Lorenzo Bramanti, considerato da molti un’autorità in questo ambito, purtroppo è scomparso poco prima della pubblicazione. Per questo, anche, merita una particolare citazione.

✨ Curiosità della settimana

La stessa molecola potenzialmente cancerogena, diventa uno scudo contro i patogeni

«Ah giovanò,'sta mano pò esse fero o pò esse piuma... oggi è stata piuma»

Parafrasando il mitico “Principe” Mario Brega: la realtà cambia in funzione del contesto. Anche quando si parla dell’effetto delle molecole sul microbiota: la colibactina, tossina che danneggia il DNA.
La colibactina pò esse fero per l’essere umano, poiché è ipotizzato da tempo che sia legata all’incidenza di cancro colorettale e prodotta da batteri specifici. Quindi non la consideriamo una stretta alleata della salute del nostro microbiota.

D’altra parte, pò esse piuma per le api. Recentemente è stato individuato uno specifico batterio nell’intestino delle api, il Frischella perrara, che produce sempre colibactina, ma il target dei suoi danni sono i patogeni pericolosi per l’ape mellifera, senza danneggiare le altre specie presenti nel microbiota dell’ape. In questo caso si può parlare di coevoluzione dove il batterio potenzialmente pericoloso diventa un’arma selettiva verso i microrganismi non autoctoni dell’intestino dell’ape. Tuttavia, se non si presentano patogeni in maniera significativa, la presenza di colibactina si rivolta contro l’ape che vivrà meno a lungo.

Fonte verificata: Song, Powell et al. 2026, Nature Microbiology
DOI: 10.1038/s41564-026-02438-9

Se hai dei chiarimenti da chiedere… lascia un commento. E se ti stai chiedendo cosa c’entra la municipale nel titolo… beh, caRcola…

Buona fermentazione!
Flavio

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Ci sono dettagli che ci sembrano ininfluenti, quel gesto a cui non diamo peso o l’elemento di cui nessuno sembra accorgersi, ma poi risulta determinante. Questa settimana, di rientro dalle vacanze per tanti, vediamo tre storie di dettagli, di attenzioni non date, che tuttavia sono quelle che fanno la vera differenza.

🔬 Scienza del microbiota umano

Il formaggio fuso per il tuo microbiota non conta come fermentato

Negli ultimi anni, anche il formaggio si è agganciato al treno dei fermentati come benefico per il tuo microbiota. Si sprecano gli articoli dove si riabilita il formaggio: da elemento da escludere da qualunque dieta sana, ad alleato quotidiano per un microbiota in salute.
Pur riconoscendo il valore gastronomico dei formaggi, credo che non sia così centrale in una dieta salutare e che dovremmo continuare a mangiarlo (con parsimonia e selezionando prodotti di qualità) principalmente perché ci piace. Tuttavia, un recente studio ha deciso di valutare gli effetti del formaggio Cheddar sul microbiota intestinale umano, ma in funzione di come lo mangiamo.

Lo studio ha previsto l’analisi del microbiota di 69 partecipanti, suddivisi in 3 gruppi, prima e dopo 6 settimane dall’intervento alimentare. I partecipanti hanno mangiato giornalmente 120gr di Cheddar irlandese, stagionato 8-12 mesi, suddivisi secondo diverse modalità di consumo:
- Cheddar senza nessuna manipolazione
- Cheddar scaldato al microonde o grigliato
- Cheddar “destrutturato“, ovvero una miscela di burro, caseinato di calcio in polvere e un integratore di calcio, formulati per essere nutrizionalmente identici al formaggio

Il risultato dello studio, seppur con diversi limiti, ha mostrato che solo il gruppo che mangiava il formaggio NON fuso ha visto un aumento significativo della diversità batterica fecale (Shannon p = 0,014; Simpson p = 0,045). Aumentano Dorea ed Erysipelotrichaceae UCG-003 — entrambi batteri fermentanti, produttori di acidi grassi a catena corta e i Bacteroides risultano più abbondanti.

I limiti dello studio, ammessi dagli autori, sono riferiti a un numero piccolo di partecipanti, distribuiti non uniformemente fra i gruppi e tutti appartenenti a una stessa fascia di età. Uno studio poco “trasversale“. Tuttavia, l’ipotesi è che scaldare il formaggio uccida gran parte dei microrganismi e limiti l’effetto protettivo dell’alimento sui postbiotici: il delivery biologico nel kimchi di cui ho parlato in una precedente newsletter, QUI.

Lo studio conferma che, nel limite del possibile, è sempre preferibile mangiare fermentati che non hanno subito trattamenti termici importanti (e.g. cottura, pastorizzazione)

Fonte verificata: Ní Chonnacháin, Gibney, Feeney et al. 2026, Frontiers in Microbiology 17:1702111
DOI: 10.3389/fmicb.2026.1702111

🌍 One Health & microbioma ambientale

L'erba del vicino cambia il sapore del vino

Questa ormai è diventata la mia rubrica preferita. Ogni settimana, continuiamo a trovare evidenze negli studi che è l’interazione fra gli elementi di un ecosistema l’aspetto più importante per la salute dell’ecosistema stesso. La Biologia, è la scienza del cambiamento e delle interazioni, la scienza del 1+1=3 ed è per questo che la ritengo da sempre la Scienza che regola il mondo in cui viviamo, ma essendo biologo è come chiedere all’oste se il vino è buono.

Tornando on topic, sempre a proposito di vino, c’è una pratica diffusa fra i viticoltori (evidentemente del segno dei Gemelli come me) che è quella di lasciar crescere l’erba fra i filari. Questo da sempre aiuta a ridurre l’erosione, trattenere l’umidità nel terreno e molto altro. Ma, come visto in altre newsletter, anche qui il microbioma ambientale di un ecosistema agricolo ad alta biodiversità ha un effetto positivo sui frutti della coltivazione. In uno studio di agosto, sono stati confrontati i risultati di due vigneti di Cabernet Sauvignon in cui la gestione dell’erba era opposta (terreno erboso vs. terreno lavorato e ripulito). I risultati sull'uva coltivata nel terreno erboso erano quasi “prevedibili”: solidi solubili +5,75%, zuccheri +6,33%, polifenoli totali +15,85%, antociani +11,12%. Generalizzando, un’uva “migliore”.
Inoltre, che è la cosa interessante, l’erba fra i filari sembra essere una fonte di microrganismi che influenza positivamente anche la fermentazione di quest’uva. La fermentazione dell’uva “erbosa” ha mostrato un aumento dell'abbondanza relativa di Saccharomyces del 45,21% e ridotto Gluconobacter del 78,78%. Questo bilanciamento microbico è associato a un miglior risultato in bottiglia, secondo lo studio. I vini del vigneto erborso hanno mostrato maggiori quantità di esteri, note di frutti di bosco scuri, floreali, tostate, minerali e speziate più pronunciate.

Ma poi… Se a voi piacciono tanto i vini con una “volatile“ marcata, chi sono gli scienziati per giudicarvi? E ricordiamoci che un vigneto non fa primavera, ma è un’indicazione promettente. Sarebbe utile inserire un terzo gruppo nel prossimo studio: gli agricoltori che ne fanno uso personale: potremmo avere grandi sorprese!

Fonte verificata: Bai, Gao et al. 2026, npj Science of Food
DOI: 10.1038/s41538-026-01053-6

✨ Curiosità della settimana

L’impronta digitale microbica cambierà i finali dei processi?

Roberta Bruzzone e tutti i criminologi wannabe da prima serata, preparatevi a dover studiare il microbioma!

L’impronta digitale è da sempre una prova cardine di tantissimi processi. Pensate a quanto è diventata famosa la “traccia 33” di Garlasco. Da oggi, si potrà pensare di aggiungere un nuovo elemento all’analisi dell’impronta digitale. Infatti, uno studio pubblicato su Genes il 10 agosto 2026 da due ricercatori forensi dell'Università di New Haven si è chiesto se i microbi possano dire quando l'impronta è stata lasciata.
Uno dei problemi più grandi (a quanto ho letto!) è che non è possibile determinare, con un buon grado di sicurezza, quanto tempo prima è stata lasciata l’impronta. L’incertezza poi aumenta notevolmente col tempo.

Nello studio, è stata analizzata la composizione microbica dell’impronta a 6, 96 e 192 ore. Da questa analisi è emerso un nucleo di microrganismi che non varia nel tempo (potenzialmente utile per riconoscere il donatore) e un sottogruppo di taxa (gruppo di microrganismi) transitori a bassa concentrazione che cambia in maniera importante in relazione al tempo. Questo cambiamento della composizione del microbioma nel tempo viene definito dai ricercatori cronomicrobioma.

Come sempre, c’è un limite notevole: se il criminale è un fan della hygiene hypothesis, siamo fregati! Lavarsi frequentemente le mani rende il metodo poco efficace (che mi sembra abbastanza evidente come concetto). Ulteriore motivo per diffidare da chi si lava troppo!

Lo studio è un “proof-of-concept”, poiché è stato condotto solo su 2 donatori, per verificare che l’ipotesi possa essere realistica. Da qui, sarà necessario mettere in piedi un vero e proprio studio che validi il modello.

Fonte verificata: De Alcaraz-Fossoul & Sawyer 2026, Genes 17(8):931
DOI: 10.3390/genes17080931

Come dicono le Mamme: “mi raccomando lavati sempre le mani, soprattutto se devi delinquere!“

Buona fermentazione,
Flavio.

Con l’avanzare dell’estate, ogni anno di più, si evidenzia l’influenza del riscaldamento climatico sull’ambiente e di riflesso sul nostro benessere. Non siamo sistemi isolati autosufficienti, ma parte di un ecosistema in continuo mutamento che dipende nel suo stato di salute dall’ambiente che lo circonda. Quello che mangiamo, dove viviamo e le nostre abitudini influenzano anche l’espressione delle varianti del nostro DNA.

🔬 Scienza del microbiota umano

La prossima frontiera è il dentifricio al kimchi?

Sono anni che sappiamo che c’è una strettissima relazione fra microbiota intestinale e alimenti fermentati. Una forte accelerazione di interesse sull’argomento lo abbiamo raggiunto nel 2021 con una famosissima pubblicazione del Sonnenburg Lab, dove si evidenziava per la prima volta, in maniera così esplicita, che c’è una correlazione fra il consumo di alimenti fermentati, la biodiversità del microbiota intestinale e salute in generale. L’articolo in questione, puoi leggere qui a proposito, fece tantissimo rumore e in questi giorni ha ripreso inaspettatamente il palco su LinkedIn fra molti esperti del settore.

Oggi l’interesse si sposta anche su altri lidi (distretti umani), ovvero il microbiota orale, che è un altro argomento di tendenza del momento. Poco tempo fa, è uscita una review* su Nature Reviews Microbiology a cura di un team della University of Pennsylvania e della Yonsei University, che ricostruisce per la prima volta come il microbioma dei cibi fermentati agisca sull'intero tratto digestivo, a partire dalla bocca, “modulando l'ecologia microbica (inclusi effetti sulla soppressione di patogeni) e… promuovendo l'integrità della barriera epiteliale e la segnalazione immunitaria”.

*una review è un articolo scientifico che raccoglie tutte le conoscenze disponibili relative a uno specifico argomento. Si tratta dello stato dell’arte di un argomento alla data di pubblicazione.

Un aspetto estremamente interessante emerso dalla review è la potenziale superiorità delle verdure fermentate, come crauti e kimchi, rispetto a latticini (e.g. yogurt, kefir) nell’influenzare il microbiota. Secondo gli autori, i microrganismi vivi e i loro postbiotici (i.e. metaboliti) vengono veicolati nell’organismo meglio ed entrano maggiormente in contatto con le mucose, dove portano i loro effetti benefici, se protetti dalla matrice vegetale in cui si trovano. Fondamentalmente la verdura funge da “capsula“ alimentare naturale per i batteri e i loro prodotti metabolici.

Questa non è una finezza da poco! L’alimento fermentato vegetale è un sistema di delivery biologico più efficace rispetto ai latticini. Un kimchi funziona meglio di un kefir per semplificare. Se poi parliamo di kefir commerciali, non c’è proprio termine di paragone.

Il futuro, è approfondire il ruolo dei fermentati vegetali in un’alimentazione di precisione, in modo che si possano scegliere i giusti fermentati per ogni condizione.

Fonte verificata: Kim, Koo et al. 2026, Nature Reviews Microbiology · DOI: 10.1038/s41579-026-01333-8

🌍 One Health & microbioma ambientale

I microbi dei parchi sono più efficienti dei loro cugini di foresta

In ogni newsletter sto sottolineando l’importanza del rewilding microbico urbano. Riportare il verde e le piante nelle città al fine di promuovere lo sviluppo di un microbioma ambientale che abbia effetti positivi sulla salute umana. Più verde, più salute.

Fino a ieri, il principio poteva essere quello di prendere come riferimento il microbioma di una foresta o un bosco e cercare di replicare il risultato nelle città. Il modello a cui ambire è quello di avvicinarsi il più possibile a un contesto naturale sano. Tuttavia, la Natura non è statica, ma è un sistema molto complesso e in costante mutamento (vedi alla voce “Evoluzione“) e la scoperta di un team del South China Botanical Garden pubblicata su Nature Cities nel marzo 2026, conferma questo aspetto.

I ricercatori hanno confrontato il microbioma del suolo di parchi urbani con quello di foreste naturali, scoprendo che quelli dei parchi urbani sono più efficienti. I microbi urbani lavorano di più: i geni per il ciclo del carbonio, dell'azoto, del fosforo e dello zolfo sono significativamente potenziati rispetto alle foreste. Evidentemente, la pressione selettiva dell’ambiente urbanizzato ha selezionato dei microrganismi più adatti a questo ambiente.
Tuttavia, il microbioma del parco urbano ha una minore biodiversità, rendendolo meno resiliente. In caso di cambiamenti climatici (“ci abitueremo al clima caraibico” cit.) i microrganismi dei parchi urbani potrebbero non essere capaci di adattarsi nuovamente, perché hanno meno frecce (specie microbiche) al proprio arco (ecosistema).

Fonte verificata: South China Botanical Garden — Nature Cities 2026 · DOI: 10.1038/s44284-026-00412-4

✨ Curiosità della settimana

I batteri intestinali del primo anno di vita modificano il rischio neurologico a tre anni. Ma c’è un “ma“!

Questo è il click bait della settimana. Parole come autismo, ADHD e bambini tutti in una stessa frase, solitamente fanno detonare i commenti sui social. E chi sono io per non approfittarne!?!?!
Scherzi a parte, la relazione fra sviluppo neurologico e microbiota è un tema caldo, incandescente.
Uno degli ultimi studi usciti è un articolo della Chinese University of Hong Kong pubblicato su Cell Press Blue il 2 giugno 2026 ha analizzato 571 neonati seguiti per tre anni, combinando dati di metilazione del DNA alla nascita con campioni di microbiota intestinale raccolti a 2, 6 e 12 mesi, e valutazioni dello sviluppo neurologico a 36 mesi.
Il risultato forse più importante dell’intero studio è che bambini associati all’autismo mostravano meno segni della condizione se nel loro microbiota era presente Lachnospira pectinoschiza durante il primo anno di vita. Per l'ADHD, un effetto protettivo simile è stato osservato con Parabacteroides distasonis.

In parole povere?
I pattern epigenetici, ovvero “tutto quello che non è DNA”, come modalità di parto, allattamento, esposizione agli antibiotici, alimentazione e molto altro, influenzano la formazione del microbiota del bambino. Il microbiota, a sua volta, influenza l’espressione dei tratti delle condizioni.

Attenzione, il microbiota non è la causa della condizione, ma può influenzarla. Si tratta di un dialogo continuo fra le parti, microrganismi e DNA. Un altro “ma” è che si tratta comunque di uno studio osservazionale, non dimostra causalità. In futuro, si dovranno testare procedure di modulazione attiva del microbiota sperando di ottenere i risultati “protettivi“ ipotizzati.

Per valutare la bontà di questo articolo ho chiesto un’opinione a una grande esperta (e amica), la Dr.ssa Valentina Biagioli esperta proprio di di questi temi. Mi ha confermato che questo articolo è estremamente interessante e lo ha usato spesso nelle sue presentazioni congressuali, al fine di evidenziare che espressione genica e microbiota non sono sistemi isolati fra loro, ma si influenzano costantemente.
Lo sviluppo neurologico non è scritto irrimediabilmente alla nascita, ma è un dialogo continuo e il microbiota è un iterlocutore importante.

Fonte verificata: Ng, Tun, Chan et al. 2026, Cell Press Blue · DOI: 10.1016/j.cpblue.2026.100009

Lavatevi i denti col kimchi! Scherzo..

Flavio.

Questa settimana tutte e tre le storie hanno un filo nascosto in comune: microbi che esistono ma che nessuno riusciva a vedere. Nel corallo, nelle verdure fermentate, nel tuo intestino. La mappa del mondo microbico che abitiamo è ancora per due terzi sconosciuta — e oggi possiamo inserire tre nuovi punti su quella mappa che fino a poco fa erano bianchi.

🔬 Scienza del microbiota umano

Le verdure fermentate non sono solo probiotici: sono ecosistemi alimentari vivi

Crauti, kimchi, olive in salamoia — le verdure latto-fermentate sono tra gli alimenti più antichi che l’uomo consumi. Eppure la ricerca scientifica sulle loro interazioni con il microbiota è rimasta a lungo in secondo piano rispetto ai latticini fermentati. Una mini-review pubblicata su Frontiers in Nutrition il 23 luglio 2026, da un team della Charité di Berlino e della TU Graz, prova a colmare questa lacuna con un cambio di prospettiva concettuale che vale la pena capire.

L’idea centrale: una verdura latto-fermentata non è un contenitore di batteri benefici. È un ecosistema microbico in evoluzione, dove la successione ecologica tra specie batteriche produce centinaia di composti bioattivi — acidi organici, aminoacidi, fitocomposti trasformati, lipidi, micronutrienti — che interagiscono con l’organismo attraverso percorsi multipli. Non è il singolo batterio che conta, è la rete di metaboliti che quel processo genera.

La formazione del microbioma degli alimenti fermentati è un argomento complesso che ho provato ad affrontare a livello divulgativo tempo fa sul blog. Se vuoi farti del male o non riesci a prendere sonno stanotte puoi leggere la serie di articoli a riguardo cliccando QUI.

I meccanismi che sono stati identificati dagli autori lungo l’asse microbioma-intestino-cervello includono: modulazione della barriera intestinale, regolazione immunitaria locale e sistemica, segnalazione enteroendocrina, vie vagali autonomiche. Un’attenzione particolare va all’intestino tenue come interfaccia precoce — un punto spesso trascurato rispetto al colon.

Gli autori riconoscono che le prove cliniche sull'uomo sono ancora limitate, e che gli studi sul legame diretto con la salute neuropsicologica praticamente non esistono ancora. Questa review mappa meccanismi plausibili, non dimostra effetti clinici provati. Ancora non risponde alle domande, ma le formula nel modo giusto.

Fonte verificata: Gonza, Ngandeu Schepanski et al. 2026, Frontiers in Nutrition · DOI: 10.3389/fnut.2026.1903488

🌍 One Health & microbioma ambientale

Il microbioma della Grande Barriera Corallina: la più grande mappa microbica di un ecosistema marino mai costruita

Campionare 48 siti lungo i 2.300 chilometri della Grande Barriera Corallina australiana. Filtrare l’acqua marina. Sequenziare tutto. Risultato: oltre 800.000 genomi microbici identificati, tra cui più di 300.000 tipi distinti di virus, 5.283 genomi batterici e oltre 500 specie nuove non presenti in nessun database esistente.

È il Great Barrier Reef Microbial Genomes Database (GBR-MGD), pubblicato su Nature il 22 luglio 2026 da un team dell’Australian Institute of Marine Science e dell’Università del Queensland. I ricercatori lo descrivono come l’equivalente marino del progetto Human Microbiome del 2012 — quella mappatura che ha aperto un decennio di scoperte sulla salute intestinale, immunitaria e metabolica. La logica è identica: prima costruisci il database di riferimento, poi puoi capire cosa cambia quando l’ecosistema si ammala.

Il dettaglio metodologico più rilevante: i batteri più abbondanti della barriera — Pelagibacter, Prochlorococcus, SAR86 — erano sistematicamente invisibili alle tecnologie standard, non perché rari, ma perché il loro DNA era complicato da leggere per i macchinari.

Il risultato più sorprendente riguarda la gestione dell’ecosistema: analizzando il microbioma dell’acqua marina attorno ai 48 siti, il team ha predetto con il 74,6% di accuratezza se quella zona era protetta dalla pesca o aperta. I microbi dell’acqua raccontano lo stato di salute della barriera — e riflettono le scelte umane fatte anni prima.

Fonte verificata: Robbins, Yeoh et al. 2026, Nature · DOI: 10.1038/s41586-026-10778-z

✨ Curiosità della settimana

Nel tuo intestino ci sono batteri che nessuno ha mai potuto crescere in laboratorio. Uno potrebbere essere la firma della buona salute.

Un grande studio internazionale dell’Università di Cambridge ha identificato un gruppo di batteri intestinali poco conosciuto — chiamato CAG-170 — che compare sistematicamente in persone sane e risulta meno abbondante in chi soffre di malattie croniche. Il team ha analizzato più di 11.000 campioni da 39 paesi, confrontando persone sane con pazienti affetti da 13 malattie diverse, tra cui Crohn, cancro colorettale e Parkinson. In tutte le analisi, CAG-170 è il gruppo batterico più coerentemente associato alla salute.

Il motivo per cui nessuno lo aveva studiato prima: la maggior parte dei batteri CAG-170 non può essere coltivata in laboratorio. Li conosciamo solo attraverso la loro firma genetica. Come i microbi della Grande Barriera Corallina, esistono ma erano invisibili agli strumenti disponibili.

L’analisi genetica suggerisce che CAG-170 produce vitamina B12 in grandi quantità e aiuta a scomporre carboidrati e fibre — probabilmente a beneficio degli altri batteri del microbiota. Sono microbi che tengono in equilibrio l’ecosistema, come un’infrastruttura invisibile. Probabilmente una specie keystone (togli quella e crolla tutto).

Come ha detto il ricercatore principale Alexandre Almeida: circa due terzi delle specie nel nostro microbiota intestinale erano precedentemente sconosciute. Nessuno sapeva cosa ci facessero — e ora abbiamo scoperto che alcune sono una componente fondamentale e sottovalutata della salute umana.

Fonte verificata: da Silva, Lapkin, Almeida et al. 2026, Cell Host & Microbe · DOI: 10.1016/j.chom.2026.01.013

Buona fermentazione!
Flavio

Il microbiota è stabile. Più di quanto pensassimo — e forse più di quanto vorremmo, perché significa che cambiarlo richiede qualcosa di più di due settimane di yogurt. Ma questa settimana ho anche trovato qualcosa che vale la pena celebrare: il ricercatore che ha dato nome scientifico all'idea per cui questa newsletter esiste, ha recentemente firmato la prima linea guida europea sugli spazi verdi urbani come infrastruttura immunitaria, sempre attraverso la modulazione del microbioma ambientale!

Il tuo microbiota è più difficile da cambiare di quanto pensi — ed è una buona notizia

🔬 Scienza del microbiota umano

Centodiciannove persone sane. Quattro settimane di yogurt ogni giorno (250g). In metà dei casi, in aggiunta, 50g di fiocchi d’avena. Metagenomics, sequenziamento fecale, marcatori infiammatori nel sangue, acidi grassi a catena corta nelle feci. Insomma un sacco di paroloni per un trial clinico crossover, pubblicato sul Journal of Nutrition nel 2026, che aveva tutte le premesse per diventare un’altra storia sul microbiota che “migliora” con la dieta giusta. E invece…

Il risultato principale è stato diverso: il microbiota di persone sane è largamente stabile e resiliente a cambiamenti dietetici a breve termine. Lo yogurt ha aumentato temporaneamente l’abbondanza di Streptococcus thermophilus — da assente a circa 1% della comunità batterica — ma questi batteri sono scomparsi durante il periodo di washout. Nessuna variazione significativa negli SCFA fecali, nei marcatori infiammatori, nella permeabilità intestinale. Il microbiota si è comportato come un ecosistema maturo: ha assorbito l’intervento e è tornato al suo stato precedente.

C’è però un’eccezione significativa: un sottogruppo di 8 partecipanti con microbiota dominato da Prevotella ha risposto diversamente all’aggiunta dell’avena — aumentando la diversità interna e riducendo la divergenza tra individui. Una risposta personalizzata, legata alla composizione batterica di partenza.

Perché questa storia conta: la stabilità del microbiota è una notizia positiva per la salute, ma complica il marketing dei prodotti miracolosi. Cambiare un microbiota sano richiede interventi strutturati e duraturi — o partire dalla composizione individuale di partenza. Insomma, non basta aggiungere qualche yogurt al quotidiano, ma è necessario rivedere la propria alimentazione, abitudini e anche il contesto in cui viviamo deve essere parte di un’analisi critica.

Fonte verificata — PubMed · Thriene et al. 2026, Journal of Nutrition
DOI: 10.1016/j.tjnut.2026.101408

🌍 One Health & microbioma ambientale

Haahtela firma le prime linee guida europee: gli spazi verdi urbani sono infrastruttura immunitaria

Tari Haahtela — il ricercatore finlandese che ha formulato la Biodiversity Hypothesis, l’idea che la disconnessione dagli ecosistemi naturali impoverisca il microbiota e comprometta la tolleranza immunitaria — ha appena firmato le prime linee guida ufficiali dell’European Academy of Allergy and Clinical Immunology (EAACI) sull’impatto degli spazi verdi urbani su allergie e asma. Pubblicate su Allergy nel dicembre 2025, sono il risultato di una revisione sistematica su 2.698 studi e di un processo GRADE con 21 esperti.

Le otto raccomandazioni vanno dalla prevenzione primaria — bambini che crescono vicino a foreste hanno tassi più bassi di sensibilizzazione allergica — alla pianificazione urbana concreta. Il punto più rilevante: non tutti gli spazi verdi sono equivalenti. Le foreste (o i boschi) proteggono più dei prati, i prati più dei campi agricoli intensivi. La biodiversità microbica del suolo — non solo la presenza di verde — è la variabile che conta. Ma le due cose con tutta probabilità sono fortemente legate!

Disclaimer: questa infografica è una sintesi divulgativa dei contenuti dell'articolo citato sopra e ha scopo puramente informativo. Non costituisce consiglio medico né sostituisce la valutazione, la diagnosi o la terapia di un medico o di uno specialista.

Una nota metodologica onesta che gli stessi autori segnalano: la forza dell’evidenza è “bassa o moderata al massimo”, perché quasi tutti gli studi sono cross-sezionali. I trial controllati di lungo periodo sugli spazi verdi e la salute immunitaria praticamente non esistono ancora. Le linee guida sono un punto di partenza istituzionale, non una certezza causale.

È la prima volta che un’istituzione europea di questa statura dice esplicitamente che progettare spazi verdi urbani è fare sanità pubblica preventiva. Lo spazio verde, sia esterno ma anche progettato correttamente all’interno degli spazi costruiti, può fortemente influenzare il tuo microbiota e di conseguenza il sistema immunitario. Passeremo dal mangiare yogurt a mettere piante in ufficio?

Fonte verificata — PubMed · Haahtela et al. 2025, Allergy
DOI: 10.1111/all.70182

✨ Curiosità della settimana

I tuoi batteri intestinali hanno un orologio. E il jet lag li disturba quanto disturba te.

Nella mia vita ho viaggiato molto, cambiando continenti, stili di vita, alimentazione e fusi orari. Il ritmo circadiano, ovvero il ritmo della giornata è uno di quelli che subisce gli effetti di lunghi viaggi e il cosiddetto jet lag. Anche il microbiota intestinale segue un ritmo circadiano proprio: la composizione batterica del colon cambia in modo ciclico nell’arco delle 24 ore, sincronizzata con i tuoi ritmi di sonno, luce e alimentazione. Di notte prevalgono certi ceppi, di giorno altri. I batteri che producono butirrato — il principale carburante delle cellule che rivestono l’intestino — sono più attivi in determinate finestre temporali.

Una revisione pubblicata su Current Pharmaceutical Design nel 2026 riporta come la cronodisruption — il disturbo dei ritmi circadiani causato da turni notturni, jet lag cronico o sonno irregolare — alteri la composizione del microbiota in modo misurabile, con effetti a cascata sull’infiammazione e sulla neuroprotezione. Il collegamento con l’Alzheimer che gli autori esplorano è ancora speculativo, ma il meccanismo di base è oggi considerato consolidato.

La conseguenza pratica: mangiare fermentati a mezzanotte dopo un volo intercontinentale probabilmente non è il momento migliore. Il microbiota, come te, ha bisogno di una routine.

Fonte verificata — PubMed · Haddadi et al. 2026, Current Pharmaceutical Design
DOI: 10.2174/0113816128433445251211165723

Tre storie, tre scale diverse: una persona sana che mangia yogurt per un mese, una città europea che ripensa i suoi parchi, un batterio intestinale che segue l’orologio del sole. Il microbiota è ovunque — nei laboratori, nelle politiche urbane, nei tuoi ritmi di sonno e sta diventando sempre più il pilastro della salute delle persone e società.

Hai mai pensato che mettere una pianta in casa potesse avere un effetto così potente? Hai mai vissuto cambiamenti importanti nel tuo stato, indicando l’origine di questi cambiamenti nell’introduzione di elementi verdi vivi nel tuo ambiente quotidiano (casa o ufficio)? Sarei curioso di sapere la tua.

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Buona fermentazione!

Flavio

Dopo molto tempo, torno a fare quello che mi piace di più: scrivere e divulgare. In questa nuova newsletter dal titolo 1H Biome, parlerò sempre di fermentati, ma rappresenteranno un elemento di un argomento più ampio che tratta la relazione fra uomo, microrganismi e ambiente. Flavio.

Ogni settimana seleziono le novità più interessanti sul mondo del microbiota umano e ambientale, suddivise in 3 rubriche fisse: Scienza del microbiota umano - One Health e microbioma ambientale - Curiosità

🔬 Scienza del microbiota umano

Jens Walter, professore di ecologia, alimentazione e microbioma all’University College Cork, si è trovato di fronte a un dato scomodo: anni di ricerca sugli integratori probiotici, per poi trovare le risposte in un cambiamento dietetico strutturato. La soluzione che propone si chiama NiMe Diet — Non-industrialized Microbiome Restore — e nasce dall’osservazione di popolazioni rurali della Papua Nuova Guinea, dove le malattie croniche sono rare e il microbiota è significativamente più ricco di batteri capaci di fermentare la fibra.

In un trial clinico controllato su trenta adulti canadesi sani, tre settimane di dieta NiMe — ad altissima fibra (22g per 1.000 kcal), a base di vegetali, legumi e cereali integrali, senza latticini né grano raffinato — hanno aumentato l’attività enzimatica per la fermentazione della fibra, ridotto i batteri pro-infiammatori e migliorato i marcatori cardiometabolici. La diversità batterica complessiva non è aumentata, ma è aumentata la stabilità funzionale del microbiota: meno batteri diversi, ma meglio interconnessi e più efficienti nei processi che contano.

Il punto che vale la pena sottolineare: l avariabile è stata la dieta. Walter lo ha detto esplicitamente alla conferenza Probiota 2026 a Dublino — riconoscendo che capire questo è stata per lui una “lezione dura” dopo anni di ricerca sui biotici in capsula.

Fonte: NutraIngredients / Probiota 2026 — nutraingredients.com · Gut Microbiota for Health — gutmicrobiotaforhealth.com

🌍 One Health & microbioma ambientale

Una piazza asfaltata nel centro di una città finlandese.
Dei ricercatori ci piantano sopra vegetazione, terra compostata e legno in decomposizione. Sei mesi dopo misurano i microbi sulle superfici impermeabili vicine: la biodiversità batterica è aumentata in modo significativo anche al di là dei confini dell’intervento. Lo studio, pubblicato su Sustainable Microbiology (Oxford, aprile 2026), si chiama rewilding urbano e dimostra che la prossimità a spazi verdi — non solo la loro presenza, ma la loro qualità microbica — modifica il microbioma ambientale delle aree circostanti.

La connessione con la salute umana non è diretta ma è tracciata: l’esposizione a microbi ambientali diversificati è associata alla regolazione immunitaria attraverso i meccanismi descritti dalla Biodiversity Hypothesis di Haahtela.

In parole semplici: i microbi del suolo dei parchi urbani non sono decorazione, sono infrastruttura immunitaria. Progettare spazi verdi con logica microbica — vegetazione nativa, terreno vivo, legno che si decompone — non è paesaggistica, è sanità pubblica preventiva.

Fonte: Saarenpää et al. 2026 — Sustainable Microbiology, Oxford Academic

✨ Curiosità della settimana

Se ne parla già da un po’, ma non è stato affrontato ancora in questa newsletter: il kimchi può eliminare le microplastiche dal nostro corpo? La risposta è Nì

Nel febbraio 2026, il World Institute of Kimchi — un ente di ricerca governativo sudcoreano — ha pubblicato su Bioresource Technology uno studio che ha fatto il giro del mondo: due ceppi batterici isolati dal kimchi, Leuconostoc mesenteroides CBA3656 e Latilactobacillus sakei CBA3608, si sono dimostrati capaci di adsorbire le nanoplastiche in laboratorio e, in modelli murini germ-free, di aumentarne l’escrezione intestinale.

In parole semplici: i batteri del kimchi si “attaccano” alle particelle di plastica ultrasottile e le trascinano fuori dall’intestino invece di lasciarle accumularsi. La ricerca parla di biosorbimento — i batteri usano la propria superficie cellulare come esca per i nanoplastici. È un meccanismo elegante, e la storia ha tutto quello che serve per diventare virale: il cibo fermentato più famoso del momento che combatte uno dei problemi ambientali più discussi.

Il kimchi è una verdura fermentata tradizionale della Corea

Tuttavia, i risultati sono stati ottenuti in vitro e su topi privi di microbiota proprio. In un intestino umano reale, i batteri del kimchi devono prima sopravvivere all’acidità dello stomaco, poi competere con miliardi di batteri residenti, poi raggiungere il tratto intestinale giusto in quantità sufficiente. Nessuno di questi passaggi è garantito. I ricercatori stessi scrivono che “ulteriori studi su scala reale e integrati con il microbiota sono necessari per confermarne l’applicabilità”. Inoltre, non è garantito che tutti i kimchi prodotti a casa o acquistati, contengano questi due ceppi in grandi quantità.

Studio originale: Lee et al. 2026 — ScienceDaily · Bioresource Technology, 447: 134234, DOI: 10.1016/j.biortech.2026.134234

Buona fermentazione! 🫙